La música pasional está muy ligada a esta hermandad por el afecto de hermanos vinculados con la misma ya que son muchos los músicos que la integran.
La música procesional, ese bálsamo que alivia el peso del bancero, es la protagonista en los actos de la Ilustre y Venerable Hermandad de La Negación de San Pedro, como homenaje a los músicos, hombres y mujeres que lo hacen posible.
Tal es la vinculación con la música que tiene esta Cofradía que cuenta en su en su haber con cinco marchas procesionales dedicadas a esta Hermandad, así como un motete. Vaya desde aquí la reiteración de nuestro agradecimiento más profundo a los seis compositores.
Sería en 1999 cuando el compositor conquense Pedro J. García Hidalgo dedicaría a la Hermandad la marcha procesional «Flevit Amare”.
Posteriormente en el año 2004 José Vicente Monedero dedicó la marcha procesional “La Negación».
Un año después, en 2005, Manuel Millán de las Heras compuso y dedicó la marcha “No lo Negaste en la Cruz”.
Ya en el año 2011, Javier Calderón Zamorano también le dedicó «Banceros de la Negación”.
Ya en 2017, Juan Carlos Aguilar dedicó la marcha procesional «Arrepentimiento en el Silencio», coincidiendo con el XXV Aniversario de la Fundación.
Así mismo y por esta efeméride, se estrenó el motete «Ter Me Negabis», compuesto y dedicado a la cofradía por Pedro Pablo Morante. Motete que se canta en las escaleras de la Iglesia de San Felipe Neri al paso titular en la procesión de “El Silencio”.
Desde 2019 celebra su Solemne Función Religiosa con una misa cantada por el CORO SOTTOVOCE de Cuenca, llevando a cabo conciertos de Música Sacra con esta Coral en los años 2019, 2022 y 2023, como este de 2024, al igual que el años anterior, junto a la Banda de Adultos de la Escuela Municipal de Música de Cuenca, todos ellos bajo la dirección de Pepe Llopis